Хлорелла распространяется по всей толще воды, производя процессы в фотическом слое воды и работая там. Микроводоросль выделяет биологически активные вещества, пептиды (алелохемики), проявляет биологический антогонизм, тем самым вытесняя нежелательные организмы для своего развития, являясь помехой и конкурируя за питательные вещества.
Хлорелла запускает благоприятные эффекты самоочищения водоёма, снижает насыщенность воды биогенами. Поглощая углекислый газ, фосфор, азот, хлорелла насыщает воду кислородом, что улучшает среду обитания всех жителей водоёма.
Также хлорелла улучшает общее качество биоценоза в водоёме, ведь улучшение качества воды – залог быстрого роста и продолжительности жизни рыбы. Благоприятные эффекты вызваны улучшением параметров естественного процесса – фотосинтеза.